Da sempre il Giappone è affascinato dal fantastico, in particolare dal mondo degli spiriti.
Nimura Kensuke, matricola della scuola superiore, è uno studente diverso dagli altri. Fin da piccolo ha la capicità di vedere gli spiriti delle persone decedute e, proprio causa di questo suo "potere", non riesce a trovare una ragazza. La sua vita però è destinata a cambiare quando, per scappare da un'orda di spiriti differenti dagli altri, viene investito da una ragazza. Kagura riesce anche lei a vedere gli spiriti, ma a differenza di Kensuke, lei lavora per un'organizzazione segreta che fa a capo del ministero dell'ambiente: l' "Ufficio Contromisure Disastri Ecologici Sovrannaturali". Kensuke scoprirà così che non tutti gli spiriti che riesce a vedere sono benevoli e che Kagura proviene da un'antico casato che combatte gli spriti con una belva spirituale Byakuei, situata all'interno del suo corpo.